Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD40LGP29965 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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