Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1478.4 ms