Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms