Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms