Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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