Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms