Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COCHO43405 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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