Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNMO15061 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms