Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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