Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms