Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms