Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms