Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATSPER4Q7RTX7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms