Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms