Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM164Q5U3C3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms