Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms