Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP27-1Q3LI81 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms