Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms