Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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