Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RLFQ13129 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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