Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP4Q13115 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms