Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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