Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms