Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms