Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VLDLRP98155 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms