Protein–RNA interactions for Protein: P98077

SHC2, SHC-transforming protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC2P98077 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC2P98077 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC2P98077 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC2P98077 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC2P98077 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms