Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AIF1P55008 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AIF1P55008 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AIF1P55008 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AIF1P55008 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AIF1P55008 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AIF1P55008 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AIF1P55008 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms