Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT4P19013 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT4P19013 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT4P19013 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT4P19013 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT4P19013 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT4P19013 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT4P19013 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT4P19013 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms