Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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