Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPLO60437 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPLO60437 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPLO60437 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPLO60437 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPLO60437 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms