Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms