Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms