Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNA1Q9UIW2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms