Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms