Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms