Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP13Q92995 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP13Q92995 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms