Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms