Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms