Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms