Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms