Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms