Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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