Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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