Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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