Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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