Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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