Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms