Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms