Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SATB1-AS1-212ENST00000596152 610 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms