Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms